Kapusta kiszona jest bardzo przydatna, ale niektórzy ludzie nie mogą jej jeść.
Na przykład osoby z wrażliwym układem trawiennym mogą odczuwać ból brzucha i wzdęcia po zjedzeniu kiszonej kapusty. Nie można również stosować tego produktu podczas przyjmowania leków przeciwzakrzepowych. Witamina K znajdująca się w kapuście zniweczy działanie leków, co może prowadzić do zakrzepicy.
Nie stosować kiszonej kapusty w chorobach tarczycy. Goirogeny obecne w kapuście hamują produkcję hormonów.
Kapusta kiszona jest również przeciwwskazana dla osób z chorobami wątroby lub niewydolnością nerek.
Niewielka ilość produktu może spowodować zmiany w równowadze potasu i sodu w organizmie. Grozi to wzrostem ciśnienia krwi.